日前,來(lái)自基礎醫學(xué)院的兩位研究人員通過(guò)大腸癌基因表達譜數據篩選差異表達基因,由此分析差異表達基因在大腸癌早期轉移中所起到的關(guān)鍵作用,找到了在大腸癌轉移分子機制中可能起著(zhù)重要作用的基因。
據了解,大腸癌是消化道主要的惡性腫瘤之一, 其惡性程度高, 早期即可通過(guò)淋巴道轉移, 對人體危害極大。在轉移早期腫瘤細胞會(huì )出現形態(tài)變化使之能夠變形、游走, 這是腫瘤轉移的關(guān)鍵步驟, 因此明確腫瘤的早期轉移相關(guān)分子機制, 篩選早期轉移分子事件中的關(guān)鍵基因, 是抑制腫瘤轉移、研發(fā)靶向治療藥物的關(guān)鍵一步。
研究人員主要通過(guò)對表達譜數據中早期轉移的大腸癌數據與正常大腸數據的差異表達基因進(jìn)行篩選, 并對篩選出的基因進(jìn)行統計學(xué)及實(shí)驗驗證并進(jìn)行生物信息學(xué)分析, 通過(guò)表達譜數據分析差異表達基因與患者生存期、 腫瘤組織的分化程度及腫瘤分期之間的關(guān)系, 并通過(guò)差異表達基因在不同物種間平均進(jìn)化距離的大小, 明確這些基因的保守程度, 進(jìn)一步分析差異表達基因相互作用蛋白及相互作用蛋白所組成的網(wǎng)絡(luò )模塊, 明確差異表達基因在大腸癌轉移中所起的重要作用。
研究人員最終篩選出了與大腸癌早期轉移相關(guān)差異表達基因共16個(gè), 其中表達上調的9個(gè)基因分別為 VSNL1, PSAT1, KIAA1199, ABHD7, MMP7, JUB, CLDN1, KRT23, FOXQ1. 表達下調的 7個(gè)基因分別為 SFRP1, SLC4A4, CHGA, GCG, GUCA2B, CLDN8, CD177。經(jīng)過(guò)分析, 與組織分化程度相關(guān)的基因有PSAT1和JUB, 與腫瘤分期相關(guān)的基因有VSNL1和MMP7。而且VSNL1, PSAT1, CLDN1, SLC4A4, GCG基因在進(jìn)化過(guò)程中較為保守。
由此研究人員指出, 上調的9個(gè)差異表達基因及下調的7個(gè)差異表達基因在大腸癌轉移分子機制中可能起著(zhù)重要作用, 因其在大腸癌中的特異度較高, 有望能夠成為聯(lián)合診斷的分子標簽。這項研究通過(guò)對篩選的大腸癌早期轉移相關(guān)的關(guān)鍵基因的分析, 明確了關(guān)鍵基因在大腸癌轉移中所起的重要作用, 并進(jìn)一步驗證了差異表達基因在大腸癌中的特異性, 這些關(guān)鍵基因對提供大腸癌轉移相關(guān)藥物治療靶點(diǎn)及大腸癌早期轉移分子診斷有重要的指導意義。